Le CMR, Conseil des Mosquées du Rhône, est le regroupement des mosquées du Rhône, chaque mosquée reste responsable de sa structure et agit en autonomie pour sa gestion. Le but du CMR est de fédérer les mosquées et renforcer la gestion par le partage de bonnes pratiques, de conseils, de formations…
Le CTIR, Conseil Théologique des Imams du Rhône, est le regroupement des imams officiant dans les mosquées du Rhône. Le but du CTIR est d’apporter un cadre et un soutien aux imams.